Правильний полив настільки ж важливий, як і температура і достатня кількість світла. Є різні правила для поливу; і для різних сортів бонсай необхідна різна кількість води. Наприклад, сукуленти можуть прожити без води довше, ніж лігіструм. Для бонсай, за винятком сукулентів, є правило – вони потребують води раніше, ніж стають повністю сухими. Стан грунту на дотик дозволяє визначити необхідність поливу. Якщо він підсох, то рослина потребує поливу негайно.
Оскільки у кімнатних бонсай немає періоду зупинки росту, їх можна пересаджувати будь-коли протягом року. Для вуличних бонсай найкращий час для пересаджування – це з ранньої весни (березня або квітня) до початку періоду активного росту. На відміну від інших кімнатних рослин, бонсай можна вирощувати в одному і тому ж горщику протягом десятиліть, замінюючи тільки грунт в горщику, але це актуально лише у випадку, якщо власника дерева не прагне збільшити розміри дерева. Молоді дерева, які активно ростуть та товщають, необхідно пересаджувати і за необхідності збільшувати горщик.
Успіху у вирощуванні бонсай можна досягнути підтримуючи всі необхідні для рослини умови, а також правильно використовуючи всі техніки по формуванню та підтримці обраної форми бонсай.